合同檔案除具有一般檔案共性外，還具有以下3個獨有的特點。
突出的依據(jù)憑證性
依據(jù)憑證性，是合同檔案最突出也是重要的特點，意思是說依法訂立的合同對當事人具有法律的約束力。合同的訂立、生效、履行、變更以及權(quán)利義務(wù)的轉(zhuǎn)讓、終止、違約、責任等等，都必須完全地、唯一地依據(jù)合同檔案，否則，就要承擔由此產(chǎn)生的法律后果。由于具有這一作用，在市場經(jīng)濟體制下，合同檔案時維護當事人合法權(quán)益的最直接、最有效的手段之一。這點特點需要引起廣大經(jīng)營者、管理部門以及檔案工作者的重視。
形式與內(nèi)容的規(guī)范性程序較高
合同要對當事人有法律的約束力，其自身必須具備法律規(guī)定的許可性，即對于合同本身是否具有法律效力，法律規(guī)定了特定的形式，不具備法律所要求的特定形式，該合同就不具有法律效力，視為無效合同。
在訴訟中，要證明一個合同法律效力的成立，就應(yīng)當以法律要求的特定形式去加以證明。而在合同檔案管理工作中經(jīng)常發(fā)生的“證據(jù)滅失”問題，原因正是對合同形式與內(nèi)容的規(guī)范性要求不甚了解，以致在收集、保管過程中缺失了合同檔案的若干組成部分，造成合同檔案法律效力的部分乃至全部的喪失，導致當事人合法權(quán)益受到損害。
時效性強
時效是一個法律術(shù)語，指時間在法律上的效力。時間本身就是一種法律事實，能夠引起一定的法律后果?！逗贤ā贰睹穹ā返仍S多相關(guān)法律對在合同的要約、承諾、履行以及爭議解決各個不同階段內(nèi)合同的效力以及當事人各種權(quán)力、義務(wù)的存在與消滅等均有所規(guī)定，可以說時效性特征貫穿于合同始終。
管理方法：
1、合同文檔管理可以以年代結(jié)合項目性質(zhì)進行分類編號。
2、保存的合同文檔每半年清理核對一次，如有遺失、損毀，要查明原因，及時處理，并追究相關(guān)人員責任。
3、合同管理組要加強對合同檔案的統(tǒng)計工作，要以原始記錄為依據(jù)，編制合同統(tǒng)計清單。
4、合同管理組應(yīng)根據(jù)實際需要編制合同檔案檢索工具，以便有效地開展合同文檔的查詢、利用工作。
5、各分公司、各部門員工可在合同檔案管理組查閱合同文檔，確因工作需要須借出查閱，須經(jīng)分公司、部門主管領(lǐng)導簽字同意后，方可在合同管理組辦理相關(guān)借閱手續(xù)，以影印件借出。合同原件無特殊情況不得外借。
6、合同文檔的保存條件：防火，防潮。
7、合同文檔必須專人負責管理。